Las Flores de Honor son el distintivo que se conceden anualmente a los municipios participantes en el programa Viles en Flor. Hay cinco niveles: de 1 a 5 Flores de Honor. El máximo reconocimiento que puede recibir un municipio es de 5 Flores de Honor.
Son otorgadas por un jurado especializado que está compuesto por profesionales de reconocido prestigio de los sectores del viverismo, los centros de jardinería, la jardinería y el paisajismo, el turismo, la cultura y otros ámbitos relacionados con este programa en la Comunitat Valenciana. El jurado visita una vez al año todos los municipios adscritos a Viles en Flor.
Desde 2023 se suman tres nuevas categorías de Flores de Honor; la Flor Verde a la Sostenibilidad, la Flor Dorada al Turismo y la Flor Roja a la Participación Ciudadana. Solo un municipio podrá contar anualmente con alguna de estas tres nuevas Flores de Honor, que se otorgarán en la Gala anual de Viles en Flor Comunitat Valenciana.
